El mal de altura es un malestar natural que sufren los visitantes que llegan a Cusco, una geografía de montaña donde el oxígeno tiene baja presión. Para disminuir sus síntomas (náuseas, dolor de cabeza, fatiga) puede beber abundante agua, evitar las bebidas alcohólicas y las comidas grasosas. A los pocos días, los síntomas desaparecerán por sí solos.

El Salkantay Trek es una de las rutas más difíciles. Se trata de una caminata de 5 días y 4 noches hacia Machu Picchu por altas montañas cercanas al nevado Salkantay así como parajes tropicales que finalizan en la ciudad inca de Machu Picchu.

El Huchuy Qosqo trek es una de las rutas de senderismo más sencillas. Incluye una caminata de solo 17 kilómetros que incluye la visita del sitio arqueológico del Huchuy Qosqo y finaliza en la ciudad inca de Machu Picchu. Es una ruta ideal para hacer con niños.

Aunque no es lo más recomendable, sí es posible hacer algunas rutas de senderismo sin tour. Por ejemplo, el visitante puede realizar por su cuenta el Salkantay Trek, el Lares Trek, el Huchuy Qosqo Trek. La única ruta de senderismo que no se puede hacer sin tour es el Camino Inca Clásico de 4 días.